Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPDL1Q96EA4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPDL1Q96EA4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms