Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SHISA4Q96DD7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SHISA4Q96DD7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SHISA4Q96DD7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHISA4Q96DD7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms