Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2A3Q93084 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2A3Q93084 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms