Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFRSF25Q93038 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFRSF25Q93038 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms