Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP7Q93009 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP7Q93009 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP7Q93009 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP7Q93009 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP7Q93009 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP7Q93009 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP7Q93009 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP7Q93009 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP7Q93009 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP7Q93009 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP7Q93009 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP7Q93009 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP7Q93009 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP7Q93009 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP7Q93009 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP7Q93009 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP7Q93009 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP7Q93009 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP7Q93009 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP7Q93009 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP7Q93009 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP7Q93009 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP7Q93009 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP7Q93009 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP7Q93009 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP7Q93009 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP7Q93009 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP7Q93009 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP7Q93009 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP7Q93009 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP7Q93009 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP7Q93009 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP7Q93009 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP7Q93009 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP7Q93009 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP7Q93009 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP7Q93009 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP7Q93009 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP7Q93009 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP7Q93009 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP7Q93009 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP7Q93009 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP7Q93009 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP7Q93009 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP7Q93009 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP7Q93009 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP7Q93009 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP7Q93009 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP7Q93009 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP7Q93009 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP7Q93009 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP7Q93009 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP7Q93009 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP7Q93009 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP7Q93009 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP7Q93009 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP7Q93009 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP7Q93009 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP7Q93009 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP7Q93009 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP7Q93009 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP7Q93009 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP7Q93009 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP7Q93009 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP7Q93009 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP7Q93009 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP7Q93009 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP7Q93009 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP7Q93009 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP7Q93009 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP7Q93009 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP7Q93009 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP7Q93009 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP7Q93009 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP7Q93009 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP7Q93009 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP7Q93009 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP7Q93009 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP7Q93009 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP7Q93009 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP7Q93009 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP7Q93009 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP7Q93009 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP7Q93009 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP7Q93009 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP7Q93009 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP7Q93009 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP7Q93009 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP7Q93009 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP7Q93009 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP7Q93009 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP7Q93009 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP7Q93009 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP7Q93009 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP7Q93009 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP7Q93009 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP7Q93009 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP7Q93009 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP7Q93009 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms