Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ERCC4Q92889 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC4Q92889 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC4Q92889 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms