Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A6Q92581 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC9A6Q92581 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A6Q92581 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A6Q92581 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms