Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPDL3BQ92485 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMPDL3BQ92485 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms