Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR60Q8WVS4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR60Q8WVS4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR60Q8WVS4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms