Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRN4Q8WUT4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRN4Q8WUT4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRN4Q8WUT4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms