Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSC4DQ8WTU2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSC4DQ8WTU2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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