Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF27

AGAP11, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP11Q8TF27 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGAP11Q8TF27 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP11Q8TF27 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms