Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF3IP1Q8TDR0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF3IP1Q8TDR0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1054.7 ms