Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NKX2-3Q8TAU0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NKX2-3Q8TAU0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX2-3Q8TAU0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX2-3Q8TAU0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX2-3Q8TAU0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX2-3Q8TAU0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX2-3Q8TAU0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NKX2-3Q8TAU0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NKX2-3Q8TAU0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NKX2-3Q8TAU0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NKX2-3Q8TAU0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NKX2-3Q8TAU0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NKX2-3Q8TAU0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKX2-3Q8TAU0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms