Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELBQ8NG08 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HELBQ8NG08 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
HELBQ8NG08 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HELBQ8NG08 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms