Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE22Q8NFJ8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BHLHE22Q8NFJ8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms