Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF397Q8NF99 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF397Q8NF99 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF397Q8NF99 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms