Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNPLA1Q8N8W4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA1Q8N8W4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA1Q8N8W4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms