Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
C10orf53Q8N6V4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C10orf53Q8N6V4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf53Q8N6V4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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