Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4A0

GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT4Q8N4A0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GALNT4Q8N4A0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALNT4Q8N4A0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GALNT4Q8N4A0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GALNT4Q8N4A0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GALNT4Q8N4A0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT4Q8N4A0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT4Q8N4A0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT4Q8N4A0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT4Q8N4A0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT4Q8N4A0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT4Q8N4A0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT4Q8N4A0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALNT4Q8N4A0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.1 ms