Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLF2Q8IX21 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLF2Q8IX21 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLF2Q8IX21 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms