Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN4Q8IWV2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTN4Q8IWV2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms