Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDCD3Q8IVD9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD3Q8IVD9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDCD3Q8IVD9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms