Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VPS37DQ86XT2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VPS37DQ86XT2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS37DQ86XT2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS37DQ86XT2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS37DQ86XT2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS37DQ86XT2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VPS37DQ86XT2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS37DQ86XT2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS37DQ86XT2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS37DQ86XT2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS37DQ86XT2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS37DQ86XT2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
VPS37DQ86XT2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS37DQ86XT2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS37DQ86XT2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS37DQ86XT2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VPS37DQ86XT2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms