Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSIG1Q86XK7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VSIG1Q86XK7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSIG1Q86XK7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSIG1Q86XK7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSIG1Q86XK7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSIG1Q86XK7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSIG1Q86XK7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSIG1Q86XK7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSIG1Q86XK7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSIG1Q86XK7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG1Q86XK7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG1Q86XK7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG1Q86XK7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG1Q86XK7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG1Q86XK7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG1Q86XK7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSIG1Q86XK7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms