Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ5

SGMS1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1Q86VZ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGMS1Q86VZ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGMS1Q86VZ5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SGMS1Q86VZ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms