Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YTHDF3Q7Z739 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
YTHDF3Q7Z739 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
YTHDF3Q7Z739 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms