Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX20Q7Z614 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX20Q7Z614 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms