Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP9Q7RTR0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NLRP9Q7RTR0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLRP9Q7RTR0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms