Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2AQ7L0J3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SV2AQ7L0J3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2AQ7L0J3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms