Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZXV5

TMTC3, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC3Q6ZXV5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMTC3Q6ZXV5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMTC3Q6ZXV5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMTC3Q6ZXV5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMTC3Q6ZXV5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMTC3Q6ZXV5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMTC3Q6ZXV5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMTC3Q6ZXV5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMTC3Q6ZXV5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms