Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BBS12Q6ZW61 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BBS12Q6ZW61 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BBS12Q6ZW61 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BBS12Q6ZW61 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms