Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM47EQ6ZV65 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM47EQ6ZV65 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM47EQ6ZV65 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM47EQ6ZV65 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms