Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SRCAPQ6ZRS2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SRCAPQ6ZRS2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SRCAPQ6ZRS2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms