Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LMBR1LQ6UX01 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMBR1LQ6UX01 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMBR1LQ6UX01 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms