Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBA3EQ6PEY2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBA3EQ6PEY2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA3EQ6PEY2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms