Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.374e-22■■■■■ 56
PRPF8Q6P2Q9 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 36.51□□□□□ -1.374e-22■■■■■ 56
PRPF8Q6P2Q9 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 54.59□□□□□ -1.674e-22■■■■■ 56
PRPF8Q6P2Q9 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.844e-22■■■■■ 56
PRPF8Q6P2Q9 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.044e-22■■■■■ 56
PRPF8Q6P2Q9 CLASP1-211ENST00000474065 516 ntTSL 36.06□□□□□ -1.449e-8■■■■■ 56
PRPF8Q6P2Q9 SCN9A-204ENST00000452182 1618 ntTSL 1 (best)9.56□□□□□ -0.887e-10■■■■■ 56
PRPF8Q6P2Q9 SCN9A-205ENST00000454569 1585 ntTSL 1 (best)9.06□□□□□ -0.967e-10■■■■■ 56
PRPF8Q6P2Q9 DDX1-205ENST00000470674 556 ntTSL 23.19□□□□□ -1.96e-8■■■■■ 56
PRPF8Q6P2Q9 GCNT2-215ENST00000489819 409 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.414e-7■■■■■ 55.9
PRPF8Q6P2Q9 GCNT2-214ENST00000489225 932 ntTSL 1 (best)9.13□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 55.9
PRPF8Q6P2Q9 GCNT2-205ENST00000410107 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 55.9
PRPF8Q6P2Q9 GCNT2-212ENST00000485764 608 ntTSL 56.63□□□□□ -1.354e-7■■■■■ 55.9
PRPF8Q6P2Q9 GCNT2-207ENST00000461400 320 ntTSL 36.51□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 55.9
PRPF8Q6P2Q9 GCNT2-209ENST00000474983 1933 ntTSL 1 (best)6.47□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 55.9
PRPF8Q6P2Q9 GCNT2-211ENST00000483204 1615 ntTSL 25.99□□□□□ -1.454e-7■■■■■ 55.9
PRPF8Q6P2Q9 GCNT2-216ENST00000495262 2214 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 55.9
PRPF8Q6P2Q9 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.514e-7■■■■■ 55.9
PRPF8Q6P2Q9 GCNT2-204ENST00000397423 3528 ntTSL 1 (best)4.74□□□□□ -1.654e-7■■■■■ 55.9
PRPF8Q6P2Q9 GCNT2-210ENST00000475577 547 ntTSL 44.21□□□□□ -1.744e-7■■■■■ 55.9
PRPF8Q6P2Q9 GCNT2-208ENST00000474518 580 ntTSL 43.26□□□□□ -1.894e-7■■■■■ 55.9
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPH3-206ENST00000478698 1507 ntTSL 211.85□□□□□ -0.517e-9■■■■■ 55.9
PRPF8Q6P2Q9 HSPA8-223ENST00000534567 588 ntTSL 43.45□□□□□ -1.862e-10■■■■■ 55.9
PRPF8Q6P2Q9 AFF1-204ENST00000503477 1478 ntTSL 213.55□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 55.9
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-215ENST00000483461 495 ntTSL 415.23■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 55.8
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-205ENST00000466642 1023 ntTSL 415.03■□□□□ -03e-6■■■■■ 55.8
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-208ENST00000467999 747 ntTSL 514.72□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 55.8
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-221ENST00000488245 784 ntTSL 512.84□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 55.8
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-226ENST00000496334 565 ntTSL 59.38□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 55.8
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-228ENST00000497883 605 ntTSL 37.43□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 55.8
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-224ENST00000494536 581 ntTSL 26.73□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 55.8
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-222ENST00000491621 753 ntTSL 35.24□□□□□ -1.573e-6■■■■■ 55.8
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-218ENST00000487042 889 ntTSL 53.02□□□□□ -1.933e-6■■■■■ 55.8
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-210ENST00000475462 560 ntTSL 43.02□□□□□ -1.933e-6■■■■■ 55.8
PRPF8Q6P2Q9 UGP2-209ENST00000472047 558 ntTSL 41.92□□□□□ -2.13e-6■■■■■ 55.8
PRPF8Q6P2Q9 ATXN2L-206ENST00000561539 509 ntTSL 31.88□□□□□ -2.111e-19■■■■■ 55.7
PRPF8Q6P2Q9 ATXN2L-220ENST00000566080 329 ntTSL 30.75□□□□□ -2.291e-19■■■■■ 55.7
PRPF8Q6P2Q9 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.262e-7■■■■■ 55.7
PRPF8Q6P2Q9 POLR1B-209ENST00000448770 2494 ntTSL 1 (best)10.1□□□□□ -0.795e-7■■■■■ 55.7
PRPF8Q6P2Q9 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.885e-7■■■■■ 55.7
PRPF8Q6P2Q9 POLR1B-202ENST00000333990 4376 ntTSL 1 (best)9.45□□□□□ -0.95e-7■■■■■ 55.7
PRPF8Q6P2Q9 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 55.7
PRPF8Q6P2Q9 POLR1B-217ENST00000541869 5059 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -15e-7■■■■■ 55.7
PRPF8Q6P2Q9 POLR1B-203ENST00000409894 4457 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.135e-7■■■■■ 55.7
PRPF8Q6P2Q9 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.265e-7■■■■■ 55.7
PRPF8Q6P2Q9 RIN1-207ENST00000534824 1834 ntTSL 215.65■□□□□ 0.17e-29■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 AP2A2-207ENST00000526376 586 ntTSL 313.58□□□□□ -0.246e-15■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 BRD3-203ENST00000371842 574 ntTSL 513.21□□□□□ -0.36e-15■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 RIN1-202ENST00000524804 847 ntTSL 212.2□□□□□ -0.467e-29■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.677e-29■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 KNTC1-208ENST00000535410 331 ntTSL 1 (best)10.12□□□□□ -0.796e-15■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 PGD-208ENST00000493288 476 ntTSL 39.05□□□□□ -0.966e-15■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 NBEAL1-207ENST00000478884 1012 ntTSL 1 (best)8.69□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 VPS11-203ENST00000529545 576 ntTSL 57.98□□□□□ -1.136e-15■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 MARF1-203ENST00000546864 1101 ntTSL 56.25□□□□□ -1.416e-15■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 DNTTIP2-201ENST00000359208 2199 ntTSL 26.2□□□□□ -1.426e-15■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 MARF1-213ENST00000552535 562 ntTSL 25.57□□□□□ -1.526e-15■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.756e-15■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 IPO8-211ENST00000611458 426 ntTSL 51.78□□□□□ -2.127e-29■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 DNTTIP2-205ENST00000496535 691 ntTSL 20.79□□□□□ -2.286e-15■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 PTPN12-212ENST00000494248 470 ntTSL 30.74□□□□□ -2.296e-15■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 UBA2-207ENST00000592672 353 ntTSL 30.44□□□□□ -2.347e-29■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 IPO8-204ENST00000535989 537 ntTSL 40.13□□□□□ -2.397e-29■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 JMJD1C-206ENST00000483298 772 ntTSL 2-0.77□□□□□ -2.535e-6■■■■■ 55.6
PRPF8Q6P2Q9 DHX36-212ENST00000495598 719 ntTSL 23.44□□□□□ -1.864e-8■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 DHX36-207ENST00000477549 644 ntTSL 20.42□□□□□ -2.344e-8■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 GABPB1-212ENST00000615671 6266 nt14.43□□□□□ -0.17e-11■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.587e-11■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.747e-11■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 GABPB1-203ENST00000380877 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.757e-11■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 GABPB1-208ENST00000558970 730 ntTSL 510.26□□□□□ -0.777e-11■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.797e-11■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 GABPB1-210ENST00000560825 1412 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.877e-11■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 GABPB1-205ENST00000429662 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.337e-11■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.087e-11■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPH1-225ENST00000515158 850 ntTSL 413.96□□□□□ -0.175e-37■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPH1-209ENST00000504348 594 ntTSL 412.15□□□□□ -0.465e-37■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPH1-220ENST00000513225 805 ntTSL 411.81□□□□□ -0.525e-37■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPH1-233ENST00000519455 451 ntTSL 411.39□□□□□ -0.595e-37■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPH1-234ENST00000519707 582 ntTSL 211.35□□□□□ -0.595e-37■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPH1-222ENST00000513972 761 ntTSL 210.64□□□□□ -0.715e-37■■■■■ 55.5
PRPF8Q6P2Q9 CD2AP-204ENST00000479857 404 ntTSL 32.6□□□□□ -1.994e-9■■■■■ 55.4
PRPF8Q6P2Q9 MBTPS1-210ENST00000565863 597 ntTSL 417.92■□□□□ 0.468e-8■■■■■ 55.4
PRPF8Q6P2Q9 MBTPS1-213ENST00000569770 763 ntTSL 317.1■□□□□ 0.338e-8■■■■■ 55.4
PRPF8Q6P2Q9 MBTPS1-206ENST00000563231 546 ntTSL 58.06□□□□□ -1.128e-8■■■■■ 55.4
PRPF8Q6P2Q9 TDG-203ENST00000436021 824 ntTSL 513.9□□□□□ -0.182e-10■■■■■ 55.3
PRPF8Q6P2Q9 TMEM237-211ENST00000489550 558 ntTSL 46.13□□□□□ -1.432e-18■■■■■ 55.3
PRPF8Q6P2Q9 TMEM237-210ENST00000480124 759 ntTSL 35.24□□□□□ -1.572e-18■■■■■ 55.3
PRPF8Q6P2Q9 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.39e-15■■■■■ 55.3
PRPF8Q6P2Q9 RAD54L2-206ENST00000602430 727 nt4.68□□□□□ -1.668e-9■■■■■ 55.3
PRPF8Q6P2Q9 SNHG5-208ENST00000433843 388 ntTSL 21.12□□□□□ -2.234e-8■■■■■ 55.3
PRPF8Q6P2Q9 SPG7-208ENST00000563783 573 ntTSL 321.92■■□□□ 1.12e-8■■■■■ 55.3
PRPF8Q6P2Q9 SPG7-217ENST00000568151 544 ntTSL 419.42■□□□□ 0.72e-8■■■■■ 55.3
PRPF8Q6P2Q9 SPG7-214ENST00000566371 581 ntTSL 318.38■□□□□ 0.532e-8■■■■■ 55.3
PRPF8Q6P2Q9 SPG7-220ENST00000569363 443 ntTSL 25.77□□□□□ -1.492e-8■■■■■ 55.3
PRPF8Q6P2Q9 INTS8-220ENST00000524333 3272 ntTSL 213.59□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 55.3
PRPF8Q6P2Q9 INTS8-201ENST00000343161 3434 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.494e-8■■■■■ 55.3
PRPF8Q6P2Q9 INTS8-214ENST00000523206 3351 ntTSL 1 (best)11.99□□□□□ -0.494e-8■■■■■ 55.3
PRPF8Q6P2Q9 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.644e-8■■■■■ 55.3
PRPF8Q6P2Q9 ZDHHC6-204ENST00000482410 538 ntTSL 22.46□□□□□ -2.029e-7■■■■■ 55.2
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 437.3 ms