Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGB2Q6NT52 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CGB2Q6NT52 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGB2Q6NT52 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms