Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT80Q6KB66 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT80Q6KB66 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231 ms