Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ55

TTBK2, Tau-tubulin kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTBK2Q6IQ55 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTBK2Q6IQ55 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTBK2Q6IQ55 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTBK2Q6IQ55 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTBK2Q6IQ55 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TTBK2Q6IQ55 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTBK2Q6IQ55 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTBK2Q6IQ55 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTBK2Q6IQ55 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTBK2Q6IQ55 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTBK2Q6IQ55 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTBK2Q6IQ55 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTBK2Q6IQ55 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTBK2Q6IQ55 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TTBK2Q6IQ55 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms