Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM200BQ69YZ2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMEM200BQ69YZ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms