Protein–RNA interactions for Protein: Q643R3

LPCAT4, Lysophospholipid acyltransferase LPCAT4, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4Q643R3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LPCAT4Q643R3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPCAT4Q643R3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPCAT4Q643R3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.9 ms