Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TAF3Q5VWG9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF3Q5VWG9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF3Q5VWG9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF3Q5VWG9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms