Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FOCADQ5VW36 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOCADQ5VW36 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOCADQ5VW36 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms