Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC1Q5TB30 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DEPDC1Q5TB30 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEPDC1Q5TB30 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms