Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBAP2Q5T6F2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBAP2Q5T6F2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms