Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM1

ZNF678, Zinc finger protein 678, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF678Q5SXM1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF678Q5SXM1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF678Q5SXM1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF678Q5SXM1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms