Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAT1Q5SQI0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATAT1Q5SQI0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAT1Q5SQI0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms