Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP78Q5JTW2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CEP78Q5JTW2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CEP78Q5JTW2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.1 ms