Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PITRM1Q5JRX3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PITRM1Q5JRX3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms